东海大学在1963年成立东海大学工业工程与经营资讯学系（Department of Industrial Engineering and Enterprise Information,Tunghai University）。东海大学工业工程与经营资讯学系在1990年成立硕士班。1995年设立硕士学分班。1999年成立博士班。2001年更名为现系名。